Программа представляет собой трехмерный рабочий стол в виде прозрачного куба для Windows XP и Windows Vista. CubeDesktop дает возможность работать с шестью рабочими столами, переключаться между которыми можно при помощи ярлыков, горячих клавиш или вращая куб. Каждый рабочий стол может иметь собственный набор иконок.
Вы можете перетаскивать окна между рабочими столами, создавать правила, согласно которым окна определенных приложений постоянно будут открываться на заданном рабочем столе, наблюдать в окне предпросмотра за тем, что происходит на другом рабочем столе. CubeDesktop поддерживает горячие клавиши для переключения между рабочими столами, а также некоторые дополнительные эффекты, в частности, прозрачность окон. Программа работает как в Windows Vista, так и в XP! В последней версии добавлен новый эффект 3D Desktop Roll, новые обои и менеджер иконок, добавлена поддержка клавиши Windows в сочетаниях горячих клавиш, повышена стабильность работы.